O Colégio Gregor Mendel dá um enfoque todo especial às atividades de laboratório, buscando tornar o conhecimento significativo à vida do aluno.
O Colégio entende que o ensino-aprendizagem tem de apresentar uma abordagem experimental, facilitando a compreensão dos fenômenos físicos, químicos e biológicos.
As atividades de laboratório são desenvolvidas por professores experientes nas respectivas áreas, com ampla vivência na prática laboratorial.